MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus REY15A chromosome

Total Repeats: 47021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017276	TATT	2	8	372	379	25 %	75 %	0 %	0 %	385774742
2	NC_017276	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774742
3	NC_017276	TAT	2	6	425	430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774742
4	NC_017276	ATT	2	6	466	471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774742
5	NC_017276	GTT	2	6	486	491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385774742
6	NC_017276	GTT	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385774742
7	NC_017276	CTT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385774742
8	NC_017276	TTAC	2	8	547	554	25 %	50 %	0 %	25 %	385774742
9	NC_017276	GGT	2	6	713	718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385774743
10	NC_017276	A	6	6	733	738	100 %	0 %	0 %	0 %	385774743
11	NC_017276	AG	3	6	788	793	50 %	0 %	50 %	0 %	385774743
12	NC_017276	TGC	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385774743
13	NC_017276	GTAA	2	8	896	903	50 %	25 %	25 %	0 %	385774743
14	NC_017276	GAG	2	6	923	928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385774743
15	NC_017276	ATGAGG	2	12	936	947	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385774743
16	NC_017276	TGG	2	6	991	996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385774743
17	NC_017276	TAT	2	6	1011	1016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774743
18	NC_017276	GATAA	2	10	1085	1094	60 %	20 %	20 %	0 %	385774743
19	NC_017276	ATA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774743
20	NC_017276	AGAGG	2	10	1155	1164	40 %	0 %	60 %	0 %	385774743
21	NC_017276	AT	3	6	1206	1211	50 %	50 %	0 %	0 %	385774743
22	NC_017276	TTA	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774743
23	NC_017276	ATC	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385774743
24	NC_017276	ACG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385774743
25	NC_017276	AAC	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385774743
26	NC_017276	TAA	2	6	1356	1361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774743
27	NC_017276	ATG	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385774743
28	NC_017276	AGC	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385774743
29	NC_017276	AGCT	2	8	1464	1471	25 %	25 %	25 %	25 %	385774743
30	NC_017276	G	6	6	1478	1483	0 %	0 %	100 %	0 %	385774743
31	NC_017276	AG	3	6	1531	1536	50 %	0 %	50 %	0 %	385774743
32	NC_017276	CCTT	2	8	1558	1565	0 %	50 %	0 %	50 %	385774743
33	NC_017276	AAG	2	6	1585	1590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774743
34	NC_017276	AGA	2	6	1603	1608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774743
35	NC_017276	TAA	2	6	1645	1650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774743
36	NC_017276	CAAA	2	8	1654	1661	75 %	0 %	0 %	25 %	385774743
37	NC_017276	AGA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774743
38	NC_017276	ATA	2	6	1691	1696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774743
39	NC_017276	TGG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385774743
40	NC_017276	AAG	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774743
41	NC_017276	GTATTG	2	12	1830	1841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385774743
42	NC_017276	TGA	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385774743
43	NC_017276	AGA	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774744
44	NC_017276	AGA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774744
45	NC_017276	CTA	2	6	1985	1990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385774744
46	NC_017276	GGA	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385774744
47	NC_017276	AAG	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774744
48	NC_017276	AT	3	6	2030	2035	50 %	50 %	0 %	0 %	385774744
49	NC_017276	AAG	3	9	2087	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774744
50	NC_017276	GAA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774744
51	NC_017276	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774744
52	NC_017276	ATT	2	6	2136	2141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774744
53	NC_017276	ATT	2	6	2157	2162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774744
54	NC_017276	ATT	2	6	2167	2172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774744
55	NC_017276	ATA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774745
56	NC_017276	TAT	2	6	2312	2317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774745
57	NC_017276	TAA	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774745
58	NC_017276	TAA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774745
59	NC_017276	TA	3	6	2367	2372	50 %	50 %	0 %	0 %	385774745
60	NC_017276	TAGG	2	8	2410	2417	25 %	25 %	50 %	0 %	385774745
61	NC_017276	AGA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774745
62	NC_017276	CTTT	2	8	2508	2515	0 %	75 %	0 %	25 %	385774745
63	NC_017276	AGC	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385774745
64	NC_017276	ATT	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774745
65	NC_017276	GAT	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385774745
66	NC_017276	TAA	2	6	2674	2679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774745
67	NC_017276	TGC	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385774745
68	NC_017276	AAT	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774745
69	NC_017276	TGC	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385774745
70	NC_017276	GCA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385774745
71	NC_017276	TGAT	2	8	2833	2840	25 %	50 %	25 %	0 %	385774745
72	NC_017276	TA	3	6	2913	2918	50 %	50 %	0 %	0 %	385774745
73	NC_017276	AATTGC	2	12	2930	2941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385774745
74	NC_017276	AAT	2	6	2975	2980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774745
75	NC_017276	GGTT	2	8	3170	3177	0 %	50 %	50 %	0 %	385774746
76	NC_017276	GAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774746
77	NC_017276	AAG	2	6	3203	3208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774746
78	NC_017276	CAAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	0 %	25 %	385774746
79	NC_017276	ATC	3	9	3282	3290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385774746
80	NC_017276	TAT	2	6	3305	3310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774746
81	NC_017276	AAC	2	6	3331	3336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385774746
82	NC_017276	GGA	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385774746
83	NC_017276	TGA	2	6	3388	3393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385774746
84	NC_017276	AAG	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774747
85	NC_017276	AGAA	2	8	3502	3509	75 %	0 %	25 %	0 %	385774747
86	NC_017276	CCA	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385774747
87	NC_017276	TTTA	2	8	3543	3550	25 %	75 %	0 %	0 %	385774747
88	NC_017276	TCC	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385774747
89	NC_017276	TCCTT	2	10	3690	3699	0 %	60 %	0 %	40 %	385774747
90	NC_017276	TTA	2	6	3716	3721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774747
91	NC_017276	ACTA	2	8	3768	3775	50 %	25 %	0 %	25 %	385774747
92	NC_017276	TTG	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385774747
93	NC_017276	TAT	3	9	3801	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774747
94	NC_017276	T	6	6	3809	3814	0 %	100 %	0 %	0 %	385774747
95	NC_017276	A	6	6	3823	3828	100 %	0 %	0 %	0 %	385774747
96	NC_017276	TAA	2	6	3892	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774747
97	NC_017276	TAG	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385774747
98	NC_017276	A	6	6	3919	3924	100 %	0 %	0 %	0 %	385774747
99	NC_017276	CGTTA	2	10	3933	3942	20 %	40 %	20 %	20 %	385774747
100	NC_017276	T	6	6	3989	3994	0 %	100 %	0 %	0 %	385774747
101	NC_017276	TCC	2	6	4006	4011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385774748
102	NC_017276	CTT	2	6	4051	4056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385774748
103	NC_017276	CATT	2	8	4068	4075	25 %	50 %	0 %	25 %	385774748
104	NC_017276	TC	3	6	4121	4126	0 %	50 %	0 %	50 %	385774748
105	NC_017276	TC	3	6	4157	4162	0 %	50 %	0 %	50 %	385774748
106	NC_017276	CCTCTG	2	12	4348	4359	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385774748
107	NC_017276	CTGTG	2	10	4364	4373	0 %	40 %	40 %	20 %	385774748
108	NC_017276	AAG	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774748
109	NC_017276	CCA	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385774748
110	NC_017276	GTAAT	2	10	4510	4519	40 %	40 %	20 %	0 %	385774748
111	NC_017276	AAT	2	6	4552	4557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774748
112	NC_017276	GTTTT	2	10	4584	4593	0 %	80 %	20 %	0 %	385774748
113	NC_017276	TC	3	6	4627	4632	0 %	50 %	0 %	50 %	385774748
114	NC_017276	AGG	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385774748
115	NC_017276	TCT	2	6	4794	4799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385774749
116	NC_017276	TACG	2	8	4832	4839	25 %	25 %	25 %	25 %	385774749
117	NC_017276	TA	3	6	4846	4851	50 %	50 %	0 %	0 %	385774749
118	NC_017276	ATTGAT	2	12	4856	4867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385774749
119	NC_017276	CTT	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385774749
120	NC_017276	TAA	2	6	4898	4903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774749
121	NC_017276	CTAAA	2	10	4927	4936	60 %	20 %	0 %	20 %	385774749
122	NC_017276	CCT	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385774749
123	NC_017276	CAT	2	6	5095	5100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385774749
124	NC_017276	CTTAT	2	10	5133	5142	20 %	60 %	0 %	20 %	385774749
125	NC_017276	AT	3	6	5141	5146	50 %	50 %	0 %	0 %	385774749
126	NC_017276	TCT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385774749
127	NC_017276	TAGTCT	2	12	5167	5178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385774749
128	NC_017276	TAAA	2	8	5210	5217	75 %	25 %	0 %	0 %	385774749
129	NC_017276	ATC	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385774749
130	NC_017276	TAA	2	6	5438	5443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774749
131	NC_017276	AT	3	6	5515	5520	50 %	50 %	0 %	0 %	385774749
132	NC_017276	TCA	2	6	6079	6084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385774750
133	NC_017276	ATC	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385774750
134	NC_017276	TTA	2	6	6260	6265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385774750
135	NC_017276	GTT	2	6	6269	6274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385774750
136	NC_017276	GAA	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385774750
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